IMABS

De MIAT INRA
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Pôle toulousain d'Animation des Maths-Info du Centre INRA Midi-Pyrénées 

Projet de Pôle Informatique et Mathématiques pour les Agrobiosciences (IMABS)  
Logoimabs.png
Groupe de travail : Jean-Noël Aubertot (Agir), Fabien Jourdan (Toxalim), Christèle Robert-Granié et Bertrand Servin (GenPhySE), Christine Cierco-Ayrolles, Simon de Givry et Robert Faivre (MIAT)

Le développement des méthodes et outils mathématiques et informatiques permettant l'exploitation et la valorisation des données numériques de la génomique, de la post-génomique, de l'agronomie et de l'écologie est un chantier majeur pour l'avenir du Centre Inra de Toulouse Midi-Pyrénées. Porté par l'unité Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse, le pôle Informatique et Mathématiques pour les Agrobiosciences (IMABS) est un projet d'animation scientifique autour des mathématiques et informatique. Il s'appuie sur une infrastructure (la nouvelle construction) et un collectif de chercheurs et ingénieurs du Centre Inra de Toulouse Midi-Pyrénées travaillant dans les domaines des mathématiques et informatique pour les Agrobiosciences. Le pôle IMABS se veut un espace d'animation de la communauté des mathématiciens et informaticiens du Centre qui travaillent pour les Agrobiosciences. Il vise à susciter et favoriser les échanges, à proposer une meilleure coordination des travaux menés en mathématiques et informatique dans les unités afin de les valoriser et de les rendre plus visibles.

Nota : cette page est en construction

Séminaires (salle de séminaire de l'unité MIAT)

Séminaire des doctorants du pôle IMABS - le vendredi 25 mai 218 en salle Marc Ridet Programme détaillé

Séminaires du mois d'octobre 2018

  • vendredi 5 octobre : de 10h30 à 12h :  Titre à venir Céline Brouard (INRA, MIAT)
  • vendredi 12 octobre de 10h30 à 12h :Inférence de données de réseaux multipartites par modèles à blocs latents et stochastiques. Application en écologie et ethnobiologie par Sophie Donnet (MIA Paris, INRA)
  • vendredi19 octobre de 10h30 à 12h : Pas de séminaire le 19 octobre, soutenance de thèse de Alyssa Imbert le jeudi 18 à 14h, Intégration de données hétérogènes complexes à partir de tableaux de tailles déséquilibrées
  • vendredi26 octobre de 10h30 à 12h : De la recherche à l'innovation à l'INRA. Exemple du domaine d'Innovation "Agriculture Numérique" par Denis Allard (BioSP -- CPI Agriculture Numérique, Dept. MIA, INRA)

Séminaire du GdT Mathématiques pour la biologie

 

Événements

  • Dans le cadre du projet InterLab « SingleCell », nous organisons le jeudi 18 octobre 2018 à l’INSA une journée toulousaine autour des données SingleCell. L’inscription est gratuite mais obligatoire pour faciliter l’organisation. Toutes les informations sont disponibles à l’adresse suivante : https://indico.math.cnrs.fr/event/3780/
  • Systems Biology and Gene Networks Inference: Application to Livestock Breeding and Genetics” that will be taught (in english) by Toni Reverter from CSIRO Agriculture and Food,
  • Brisbane, Australia. The course will be on November 19 - 23, 2018 (9h30 to 13h00) in INRA Toulouse:
    - Monday and Friday in Salle de conférence Marc Ridet,
    - Tuesday, Wednesday and Thursday in Salle de séminaire Biotechnologie Végétale.
  • La Plateforme BioStatistique du Genotoul organise une session du module Graphiques avancés avec R. Cette session aura lieu le 12 octobre 2018 sur le Campus INRA d’Auzeville. Information et pré-inscription à : http://perso.math.univ-toulouse.fr/biostat/?p=511. La date limite d’inscription est fixée au 15/09/2018.
  • La Plateforme BioStatistique du Genotoul organise une nouvelle session de formation « Initiation à la programmation R ». Cette session aura lieu les 11 et 12 juin 2018 sur le Campus INRA d’Auzeville.Information et pré-inscription à http://perso.math.univ-toulouse.fr/biostat/?p=546. La date limite d’inscription est fixée au 25/03/2018.
  • JFRB 2018   9èmes Journées Francophones sur les Réseaux Bayésiens et les Modèles Graphiques Probabilistes du 31 mai au 1 juin 2018 à l'INRA Toulouse
  • Séminaire des doctorants du pôle IMABS - le vendredi 25 mai 2018 en salle Marc Ridet Programme détaillé
  • La Plateforme BioStatistique du Genotoul organise une session du module 1 Analyse Statistique - Initiation à la statistique avec R. Cette session aura lieu les 26 et 27 mars 2018 sur le Campus INRA d’Auzeville. Information et pré-inscription à http://perso.math.univ-toulouse.fr/biostat/?p=538. La date limite d’inscription est fixée au 02/03/2018.

 

  • journée du réseau AIGM du 14 décembre, salle de réunion du CNRGV sur le centre INRA de Toulouse. Afin de faciliter l'organisation, merci de signaler votre participation sur le doodle suivant :https://beta.doodle.com/poll/ikk4p3ywxsyfyc6a
  • Dans le cadre d’un projet « Professeurs Invités de l’INP », Kim-Anh Le Cao de l’université de Melbourne en Australie sera à Toulouse du 23 octobre au 10 novembre 2017.  Kim-Anh Le Cao et Sébastien Déjean organisent une formation de 2 jours les 9 et 10 novembre 2017 sur le logiciel MixOmics. Cette formation est destinée en priorité aux étudiants, doctorants et post-doctorants mais est également ouverte aux chercheurs.  Si vous ou vos étudiants en thèses ou post-doct êtes intéressés, il reste quelques places.  Toutes les informations (et inscriptions) sont disponibles à l’adresse suivante : http://mixomics.org/2017/06/9-10-nov-2017-toulouse/
  • Formation « Graphiques avancés avec R » : Une formation aux outils de graphiques avancés (ggplot2, graphiques interactifs) avec R aura lieu le 27 octobre 2017, à l’INRA de Toulouse
  • Journée d'animation de la plateforme RECORD le 6 octobre. Voir le site.
  • Le séminaire XSYS consacré aux « Déplacements collectifs et mobilités » aura lieu le 4 Octobre prochain, de 13h30 à 18H00 en salle D31 de la Maison de la Recherche de l'Université Toulouse Jean Jaurès (5 Allées Antoine Machado). Gratuit mais nécessité de s'inscrire.
  • Dans la lignée de la conférence internationale UseR! et suite à la cinquième édition qui a eu lieu à Toulouse en juin 2016, la sixième édition des  Rencontres R aura lieu les 28,29 et 30 juin 2017 à Anglet  (http://angletr2017.com).
  • Journée des doctorants MIAT Maths-Info le vendredi 28 avril en salle Marc Ridet du Centre INRA d'Auzeville. Voir le Programme.Les diaporamas sont sur la page des Séminaires.
  • 2nd Advanced Lecture Course on Computational Systems Biology, that will be held in the Aussois ski resort (France) between March 19-25, 2017 (https://project.inria.fr/compsysbio2017/).
  • Rencontre du 26 janvier 2017 entre l'équipe MAD de MIAT et l'UMR Dynafor sur les thèmes de l'agroécologie et la simulation à base d'agents : Programme et Présentations.
  • Journée Bioinformatique et Biostatisque Genotoul  le 2 décembre à l'Inra d'Auzeville.
  • Vincent Fourcassié and Guy Theraulazare organizing a workshop entitled “Quantitative approaches for analyzing and modelling individual and collective behaviour” in Toulouse on December 7th, 2016 (IBCG Conference Room).This thematic day is part of the workshop series “Tackling Complexity in Biological Systems: From Data to Computational models” within the Computational and Systems Biology axis that intend to promote quantitative and modeling approaches within the CIB.
  • Colloque CARTABLE, Rencontre commune entre les réseaux méthodologiques AIGM (modèles graphiques), NETBIO (réseaux biologiques) et MOABI (Méthodologies d'Optimisation pour l'AgroBIologie) du département MIA :  12 au 14 Octobre 2016 à Toulouse.
  • CP'2016   The 22 nd International Conference on Principles and Practice of Constraint Programming du 5 au 9 septembre 2016 à Toulouse
  • Cinquièmes Rencontres R  du 22 au 24 juin 2016 à Toulouse
  • Journées du GdR Mascot-Num du 23 au 25 mars 2016 à Toulouse

Formations

 

  • Zoom métiers avec une vidéo d'Élise Maigné, Ingénieur en statistique, économétrie et base de données à l’Observatoire du Développement Rural
Génotoul BioInfo
Équipe RECORD
IMABS
Outils personnels